Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBA3EQ6PEY2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms