Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EDC4Q6P2E9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDC4Q6P2E9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms