Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf46Q504U0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms