Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Length 503 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NRF1Q16656 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NRF1Q16656 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NRF1Q16656 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NRF1Q16656 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NRF1Q16656 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NRF1Q16656 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NRF1Q16656 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NRF1Q16656 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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NRF1Q16656 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NRF1Q16656 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NRF1Q16656 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NRF1Q16656 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NRF1Q16656 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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NRF1Q16656 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NRF1Q16656 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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NRF1Q16656 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NRF1Q16656 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NRF1Q16656 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NRF1Q16656 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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NRF1Q16656 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
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NRF1Q16656 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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NRF1Q16656 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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NRF1Q16656 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NRF1Q16656 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
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