Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNHIT3Q15649 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms