Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TAF1AQ15573 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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TAF1AQ15573 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAF1AQ15573 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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