Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPAQ15257 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms