Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
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SCARF1Q14162 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
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