Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2H2Q13888 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms