Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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ITGA9Q13797 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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ITGA9Q13797 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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ITGA9Q13797 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
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ITGA9Q13797 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA9Q13797 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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