Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAPSNQ13702 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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