Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CSTF3Q12996 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSTF3Q12996 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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