Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFIAQ12857 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NFIAQ12857 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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