Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
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