Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBA52P62987 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBA52P62987 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBA52P62987 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBA52P62987 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBA52P62987 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBA52P62987 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBA52P62987 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBA52P62987 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBA52P62987 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBA52P62987 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBA52P62987 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBA52P62987 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBA52P62987 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBA52P62987 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBA52P62987 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UBA52P62987 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBA52P62987 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBA52P62987 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBA52P62987 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBA52P62987 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBA52P62987 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBA52P62987 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBA52P62987 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBA52P62987 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBA52P62987 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBA52P62987 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBA52P62987 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBA52P62987 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBA52P62987 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBA52P62987 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBA52P62987 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBA52P62987 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBA52P62987 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBA52P62987 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBA52P62987 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBA52P62987 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
UBA52P62987 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
UBA52P62987 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBA52P62987 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBA52P62987 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBA52P62987 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBA52P62987 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBA52P62987 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBA52P62987 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBA52P62987 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBA52P62987 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBA52P62987 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBA52P62987 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBA52P62987 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBA52P62987 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBA52P62987 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBA52P62987 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBA52P62987 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBA52P62987 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
UBA52P62987 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBA52P62987 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBA52P62987 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBA52P62987 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBA52P62987 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBA52P62987 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBA52P62987 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBA52P62987 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBA52P62987 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBA52P62987 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBA52P62987 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBA52P62987 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBA52P62987 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBA52P62987 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBA52P62987 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBA52P62987 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBA52P62987 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBA52P62987 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBA52P62987 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBA52P62987 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBA52P62987 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBA52P62987 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBA52P62987 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBA52P62987 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBA52P62987 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBA52P62987 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBA52P62987 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBA52P62987 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBA52P62987 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBA52P62987 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBA52P62987 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBA52P62987 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBA52P62987 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBA52P62987 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBA52P62987 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBA52P62987 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBA52P62987 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBA52P62987 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBA52P62987 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBA52P62987 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBA52P62987 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBA52P62987 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBA52P62987 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBA52P62987 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBA52P62987 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms