Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
ROMO1P60602 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms