Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LOXL3P58215 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL3P58215 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms