Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP107P57740 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP107P57740 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP107P57740 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP107P57740 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP107P57740 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP107P57740 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP107P57740 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP107P57740 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP107P57740 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP107P57740 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP107P57740 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP107P57740 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP107P57740 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP107P57740 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP107P57740 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP107P57740 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP107P57740 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP107P57740 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP107P57740 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP107P57740 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP107P57740 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP107P57740 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP107P57740 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP107P57740 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP107P57740 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP107P57740 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP107P57740 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP107P57740 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP107P57740 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP107P57740 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP107P57740 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP107P57740 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP107P57740 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP107P57740 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP107P57740 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP107P57740 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP107P57740 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP107P57740 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP107P57740 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP107P57740 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP107P57740 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP107P57740 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP107P57740 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP107P57740 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP107P57740 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP107P57740 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP107P57740 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP107P57740 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP107P57740 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP107P57740 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP107P57740 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP107P57740 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP107P57740 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP107P57740 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP107P57740 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP107P57740 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP107P57740 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP107P57740 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP107P57740 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP107P57740 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP107P57740 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP107P57740 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP107P57740 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP107P57740 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP107P57740 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP107P57740 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUP107P57740 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP107P57740 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP107P57740 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP107P57740 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP107P57740 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP107P57740 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP107P57740 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP107P57740 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP107P57740 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP107P57740 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP107P57740 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP107P57740 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP107P57740 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP107P57740 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP107P57740 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP107P57740 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP107P57740 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP107P57740 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP107P57740 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP107P57740 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP107P57740 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP107P57740 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP107P57740 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP107P57740 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP107P57740 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP107P57740 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP107P57740 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP107P57740 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP107P57740 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP107P57740 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP107P57740 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP107P57740 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUP107P57740 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms