Protein–RNA interactions for Protein: P55769

SNU13, NHP2-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNU13P55769 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNU13P55769 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNU13P55769 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNU13P55769 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNU13P55769 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNU13P55769 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNU13P55769 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNU13P55769 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNU13P55769 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNU13P55769 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNU13P55769 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNU13P55769 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNU13P55769 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNU13P55769 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNU13P55769 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNU13P55769 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNU13P55769 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNU13P55769 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNU13P55769 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNU13P55769 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNU13P55769 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNU13P55769 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNU13P55769 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNU13P55769 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNU13P55769 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNU13P55769 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNU13P55769 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNU13P55769 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNU13P55769 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNU13P55769 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNU13P55769 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNU13P55769 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNU13P55769 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNU13P55769 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNU13P55769 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNU13P55769 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNU13P55769 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNU13P55769 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNU13P55769 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNU13P55769 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNU13P55769 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNU13P55769 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNU13P55769 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNU13P55769 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNU13P55769 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNU13P55769 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNU13P55769 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNU13P55769 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNU13P55769 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNU13P55769 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNU13P55769 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNU13P55769 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNU13P55769 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNU13P55769 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNU13P55769 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNU13P55769 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNU13P55769 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNU13P55769 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNU13P55769 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNU13P55769 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNU13P55769 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNU13P55769 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNU13P55769 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNU13P55769 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNU13P55769 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNU13P55769 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNU13P55769 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNU13P55769 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNU13P55769 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNU13P55769 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNU13P55769 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNU13P55769 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNU13P55769 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNU13P55769 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNU13P55769 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNU13P55769 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNU13P55769 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNU13P55769 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNU13P55769 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNU13P55769 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNU13P55769 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNU13P55769 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNU13P55769 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNU13P55769 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNU13P55769 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNU13P55769 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNU13P55769 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNU13P55769 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNU13P55769 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNU13P55769 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNU13P55769 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNU13P55769 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNU13P55769 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNU13P55769 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNU13P55769 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNU13P55769 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNU13P55769 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNU13P55769 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNU13P55769 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNU13P55769 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms