Protein–RNA interactions for Protein: P51858

HDGF, Hepatoma-derived growth factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFP51858 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDGFP51858 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDGFP51858 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDGFP51858 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDGFP51858 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDGFP51858 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDGFP51858 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDGFP51858 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDGFP51858 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDGFP51858 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDGFP51858 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDGFP51858 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDGFP51858 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDGFP51858 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDGFP51858 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDGFP51858 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDGFP51858 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDGFP51858 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDGFP51858 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDGFP51858 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDGFP51858 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDGFP51858 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
HDGFP51858 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDGFP51858 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDGFP51858 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
HDGFP51858 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDGFP51858 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDGFP51858 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDGFP51858 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDGFP51858 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDGFP51858 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDGFP51858 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDGFP51858 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDGFP51858 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDGFP51858 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDGFP51858 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDGFP51858 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDGFP51858 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDGFP51858 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDGFP51858 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDGFP51858 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDGFP51858 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDGFP51858 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDGFP51858 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDGFP51858 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDGFP51858 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDGFP51858 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDGFP51858 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDGFP51858 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDGFP51858 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDGFP51858 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
HDGFP51858 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
HDGFP51858 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HDGFP51858 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HDGFP51858 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HDGFP51858 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HDGFP51858 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HDGFP51858 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HDGFP51858 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HDGFP51858 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HDGFP51858 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HDGFP51858 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HDGFP51858 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HDGFP51858 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
HDGFP51858 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HDGFP51858 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HDGFP51858 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HDGFP51858 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HDGFP51858 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HDGFP51858 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HDGFP51858 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HDGFP51858 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HDGFP51858 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HDGFP51858 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HDGFP51858 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HDGFP51858 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HDGFP51858 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HDGFP51858 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HDGFP51858 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDGFP51858 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDGFP51858 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDGFP51858 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDGFP51858 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDGFP51858 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDGFP51858 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDGFP51858 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDGFP51858 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDGFP51858 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDGFP51858 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDGFP51858 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDGFP51858 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
HDGFP51858 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDGFP51858 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
HDGFP51858 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDGFP51858 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDGFP51858 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
HDGFP51858 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDGFP51858 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDGFP51858 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDGFP51858 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms