Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
XCR1P46094 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
XCR1P46094 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XCR1P46094 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XCR1P46094 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XCR1P46094 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
XCR1P46094 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
XCR1P46094 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
XCR1P46094 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
XCR1P46094 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
XCR1P46094 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XCR1P46094 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
XCR1P46094 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
XCR1P46094 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XCR1P46094 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
XCR1P46094 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XCR1P46094 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XCR1P46094 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XCR1P46094 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XCR1P46094 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XCR1P46094 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
XCR1P46094 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XCR1P46094 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XCR1P46094 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
XCR1P46094 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XCR1P46094 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XCR1P46094 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XCR1P46094 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
XCR1P46094 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XCR1P46094 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XCR1P46094 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XCR1P46094 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XCR1P46094 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XCR1P46094 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
XCR1P46094 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XCR1P46094 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
XCR1P46094 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
XCR1P46094 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
XCR1P46094 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
XCR1P46094 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XCR1P46094 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XCR1P46094 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
XCR1P46094 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
XCR1P46094 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
XCR1P46094 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
XCR1P46094 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
XCR1P46094 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XCR1P46094 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XCR1P46094 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XCR1P46094 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XCR1P46094 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XCR1P46094 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XCR1P46094 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XCR1P46094 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XCR1P46094 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XCR1P46094 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
XCR1P46094 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XCR1P46094 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
XCR1P46094 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
XCR1P46094 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XCR1P46094 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XCR1P46094 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XCR1P46094 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
XCR1P46094 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XCR1P46094 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XCR1P46094 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
XCR1P46094 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XCR1P46094 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
XCR1P46094 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
XCR1P46094 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
XCR1P46094 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
XCR1P46094 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
XCR1P46094 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XCR1P46094 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XCR1P46094 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XCR1P46094 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XCR1P46094 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
XCR1P46094 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
XCR1P46094 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XCR1P46094 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
XCR1P46094 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XCR1P46094 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
XCR1P46094 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XCR1P46094 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
XCR1P46094 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XCR1P46094 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XCR1P46094 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XCR1P46094 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
XCR1P46094 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XCR1P46094 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
XCR1P46094 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XCR1P46094 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XCR1P46094 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
XCR1P46094 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
XCR1P46094 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XCR1P46094 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
XCR1P46094 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XCR1P46094 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
XCR1P46094 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
XCR1P46094 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms