Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms