Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PSMB5P28074 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMB5P28074 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms