Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms