Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYF6P23409 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYF6P23409 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYF6P23409 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYF6P23409 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MYF6P23409 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYF6P23409 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYF6P23409 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYF6P23409 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYF6P23409 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYF6P23409 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYF6P23409 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MYF6P23409 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYF6P23409 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYF6P23409 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYF6P23409 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYF6P23409 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYF6P23409 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYF6P23409 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYF6P23409 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYF6P23409 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYF6P23409 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MYF6P23409 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MYF6P23409 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MYF6P23409 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MYF6P23409 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MYF6P23409 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MYF6P23409 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MYF6P23409 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MYF6P23409 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MYF6P23409 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MYF6P23409 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MYF6P23409 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MYF6P23409 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MYF6P23409 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MYF6P23409 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MYF6P23409 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MYF6P23409 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MYF6P23409 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MYF6P23409 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MYF6P23409 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MYF6P23409 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MYF6P23409 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MYF6P23409 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MYF6P23409 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MYF6P23409 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MYF6P23409 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MYF6P23409 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MYF6P23409 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MYF6P23409 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MYF6P23409 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MYF6P23409 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MYF6P23409 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MYF6P23409 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MYF6P23409 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MYF6P23409 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYF6P23409 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYF6P23409 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYF6P23409 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYF6P23409 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYF6P23409 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYF6P23409 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYF6P23409 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYF6P23409 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYF6P23409 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYF6P23409 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYF6P23409 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYF6P23409 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MYF6P23409 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYF6P23409 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYF6P23409 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYF6P23409 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYF6P23409 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYF6P23409 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MYF6P23409 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYF6P23409 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYF6P23409 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MYF6P23409 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYF6P23409 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYF6P23409 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYF6P23409 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYF6P23409 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYF6P23409 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYF6P23409 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYF6P23409 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYF6P23409 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYF6P23409 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYF6P23409 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYF6P23409 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYF6P23409 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYF6P23409 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYF6P23409 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYF6P23409 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYF6P23409 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MYF6P23409 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYF6P23409 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYF6P23409 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYF6P23409 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYF6P23409 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYF6P23409 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms