Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCP1P17987 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCP1P17987 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCP1P17987 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCP1P17987 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCP1P17987 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCP1P17987 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCP1P17987 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCP1P17987 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCP1P17987 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCP1P17987 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TCP1P17987 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCP1P17987 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCP1P17987 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCP1P17987 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TCP1P17987 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCP1P17987 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCP1P17987 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCP1P17987 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TCP1P17987 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCP1P17987 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCP1P17987 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCP1P17987 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TCP1P17987 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCP1P17987 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCP1P17987 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCP1P17987 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCP1P17987 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCP1P17987 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCP1P17987 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCP1P17987 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCP1P17987 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCP1P17987 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCP1P17987 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCP1P17987 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCP1P17987 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCP1P17987 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCP1P17987 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCP1P17987 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCP1P17987 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCP1P17987 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCP1P17987 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCP1P17987 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCP1P17987 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCP1P17987 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCP1P17987 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCP1P17987 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCP1P17987 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCP1P17987 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCP1P17987 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCP1P17987 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCP1P17987 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCP1P17987 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCP1P17987 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCP1P17987 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCP1P17987 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCP1P17987 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCP1P17987 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCP1P17987 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCP1P17987 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCP1P17987 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCP1P17987 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCP1P17987 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCP1P17987 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCP1P17987 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCP1P17987 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TCP1P17987 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCP1P17987 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCP1P17987 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCP1P17987 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TCP1P17987 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCP1P17987 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCP1P17987 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TCP1P17987 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TCP1P17987 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TCP1P17987 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TCP1P17987 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TCP1P17987 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TCP1P17987 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TCP1P17987 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TCP1P17987 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TCP1P17987 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
TCP1P17987 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TCP1P17987 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TCP1P17987 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TCP1P17987 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TCP1P17987 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCP1P17987 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCP1P17987 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCP1P17987 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCP1P17987 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCP1P17987 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCP1P17987 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCP1P17987 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCP1P17987 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCP1P17987 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCP1P17987 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCP1P17987 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCP1P17987 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCP1P17987 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms