Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH1P12830 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH1P12830 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH1P12830 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH1P12830 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDH1P12830 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH1P12830 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH1P12830 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH1P12830 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH1P12830 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH1P12830 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH1P12830 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH1P12830 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH1P12830 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH1P12830 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH1P12830 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH1P12830 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH1P12830 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH1P12830 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH1P12830 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH1P12830 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH1P12830 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH1P12830 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH1P12830 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH1P12830 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH1P12830 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH1P12830 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH1P12830 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH1P12830 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH1P12830 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH1P12830 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH1P12830 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH1P12830 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH1P12830 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH1P12830 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH1P12830 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH1P12830 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH1P12830 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDH1P12830 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDH1P12830 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDH1P12830 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDH1P12830 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDH1P12830 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDH1P12830 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDH1P12830 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDH1P12830 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDH1P12830 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDH1P12830 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDH1P12830 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDH1P12830 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDH1P12830 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDH1P12830 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDH1P12830 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDH1P12830 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDH1P12830 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDH1P12830 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDH1P12830 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDH1P12830 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDH1P12830 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDH1P12830 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDH1P12830 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDH1P12830 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDH1P12830 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH1P12830 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH1P12830 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH1P12830 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH1P12830 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH1P12830 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH1P12830 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH1P12830 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH1P12830 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH1P12830 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH1P12830 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH1P12830 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH1P12830 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH1P12830 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH1P12830 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH1P12830 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH1P12830 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH1P12830 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH1P12830 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH1P12830 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH1P12830 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH1P12830 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH1P12830 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH1P12830 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH1P12830 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH1P12830 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH1P12830 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH1P12830 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH1P12830 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH1P12830 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH1P12830 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH1P12830 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH1P12830 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH1P12830 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDH1P12830 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH1P12830 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH1P12830 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH1P12830 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms