Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NR2F1P10589 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms