Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB5P09067 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms