Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPM2P07951 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPM2P07951 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPM2P07951 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPM2P07951 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPM2P07951 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPM2P07951 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPM2P07951 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TPM2P07951 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPM2P07951 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPM2P07951 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPM2P07951 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPM2P07951 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPM2P07951 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPM2P07951 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPM2P07951 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TPM2P07951 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPM2P07951 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPM2P07951 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPM2P07951 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPM2P07951 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPM2P07951 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPM2P07951 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPM2P07951 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPM2P07951 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPM2P07951 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPM2P07951 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPM2P07951 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPM2P07951 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPM2P07951 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPM2P07951 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPM2P07951 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPM2P07951 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPM2P07951 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPM2P07951 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPM2P07951 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPM2P07951 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPM2P07951 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPM2P07951 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPM2P07951 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPM2P07951 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPM2P07951 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPM2P07951 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPM2P07951 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPM2P07951 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPM2P07951 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TPM2P07951 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TPM2P07951 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
TPM2P07951 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TPM2P07951 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TPM2P07951 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPM2P07951 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPM2P07951 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPM2P07951 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPM2P07951 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPM2P07951 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPM2P07951 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPM2P07951 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPM2P07951 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPM2P07951 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPM2P07951 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPM2P07951 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPM2P07951 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPM2P07951 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPM2P07951 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPM2P07951 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPM2P07951 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPM2P07951 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPM2P07951 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPM2P07951 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPM2P07951 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPM2P07951 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPM2P07951 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPM2P07951 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPM2P07951 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPM2P07951 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPM2P07951 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPM2P07951 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPM2P07951 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPM2P07951 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPM2P07951 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPM2P07951 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPM2P07951 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPM2P07951 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPM2P07951 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPM2P07951 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPM2P07951 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPM2P07951 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPM2P07951 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPM2P07951 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPM2P07951 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPM2P07951 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPM2P07951 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPM2P07951 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPM2P07951 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPM2P07951 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPM2P07951 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPM2P07951 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPM2P07951 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPM2P07951 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms