Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFMP07197 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFMP07197 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFMP07197 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFMP07197 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFMP07197 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEFMP07197 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEFMP07197 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NEFMP07197 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEFMP07197 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEFMP07197 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEFMP07197 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEFMP07197 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEFMP07197 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEFMP07197 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEFMP07197 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEFMP07197 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEFMP07197 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEFMP07197 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEFMP07197 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEFMP07197 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEFMP07197 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEFMP07197 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEFMP07197 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEFMP07197 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NEFMP07197 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NEFMP07197 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEFMP07197 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEFMP07197 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEFMP07197 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEFMP07197 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEFMP07197 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEFMP07197 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEFMP07197 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEFMP07197 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEFMP07197 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEFMP07197 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEFMP07197 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEFMP07197 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEFMP07197 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEFMP07197 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEFMP07197 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEFMP07197 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEFMP07197 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEFMP07197 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEFMP07197 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEFMP07197 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEFMP07197 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEFMP07197 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEFMP07197 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEFMP07197 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEFMP07197 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEFMP07197 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NEFMP07197 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEFMP07197 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NEFMP07197 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEFMP07197 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NEFMP07197 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEFMP07197 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NEFMP07197 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEFMP07197 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEFMP07197 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEFMP07197 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEFMP07197 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEFMP07197 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEFMP07197 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEFMP07197 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEFMP07197 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEFMP07197 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEFMP07197 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEFMP07197 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NEFMP07197 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NEFMP07197 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEFMP07197 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEFMP07197 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NEFMP07197 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEFMP07197 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEFMP07197 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEFMP07197 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEFMP07197 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEFMP07197 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NEFMP07197 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEFMP07197 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEFMP07197 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEFMP07197 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEFMP07197 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEFMP07197 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEFMP07197 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NEFMP07197 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEFMP07197 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEFMP07197 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEFMP07197 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEFMP07197 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEFMP07197 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEFMP07197 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEFMP07197 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEFMP07197 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEFMP07197 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEFMP07197 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEFMP07197 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms