Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PLIN1O60240 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLIN1O60240 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms