Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EDIL3O43854 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms