Protein–RNA interactions for Protein: O14896

IRF6, Interferon regulatory factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF6O14896 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF6O14896 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF6O14896 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF6O14896 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF6O14896 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF6O14896 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF6O14896 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF6O14896 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF6O14896 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF6O14896 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF6O14896 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF6O14896 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF6O14896 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF6O14896 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF6O14896 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF6O14896 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF6O14896 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF6O14896 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF6O14896 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF6O14896 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF6O14896 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF6O14896 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF6O14896 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF6O14896 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF6O14896 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF6O14896 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF6O14896 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF6O14896 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF6O14896 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF6O14896 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF6O14896 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF6O14896 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF6O14896 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF6O14896 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF6O14896 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF6O14896 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF6O14896 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF6O14896 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF6O14896 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF6O14896 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF6O14896 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF6O14896 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF6O14896 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF6O14896 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF6O14896 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF6O14896 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IRF6O14896 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IRF6O14896 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IRF6O14896 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IRF6O14896 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IRF6O14896 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IRF6O14896 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF6O14896 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF6O14896 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF6O14896 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF6O14896 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF6O14896 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF6O14896 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF6O14896 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF6O14896 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF6O14896 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF6O14896 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF6O14896 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF6O14896 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF6O14896 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF6O14896 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF6O14896 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF6O14896 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF6O14896 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF6O14896 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF6O14896 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF6O14896 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF6O14896 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF6O14896 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF6O14896 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF6O14896 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF6O14896 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF6O14896 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF6O14896 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF6O14896 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF6O14896 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF6O14896 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF6O14896 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF6O14896 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF6O14896 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF6O14896 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF6O14896 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF6O14896 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF6O14896 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF6O14896 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF6O14896 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF6O14896 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF6O14896 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF6O14896 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF6O14896 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF6O14896 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF6O14896 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF6O14896 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF6O14896 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF6O14896 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms