Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCRIP1C9JLW8 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms