Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6L4A6NEF3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6L4A6NEF3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms