Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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