Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J244

TRAV3, T-cell receptor alpha variable 3 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV3A0A0B4J244 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAV3A0A0B4J244 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms