Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ9

KRTAP4-8, Keratin-associated protein 4-8, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-8Q9BYQ9 PPHLN1-207ENST00000432191 3377 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 CTNND1-220ENST00000529526 6099 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC015813.3-201ENST00000584805 6113 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 NXF2B-202ENST00000602195 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 NXF2-202ENST00000625106 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 NAV1-202ENST00000367296 13091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 PARP9-201ENST00000360356 3198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 RUNX1T1-249ENST00000613886 7401 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 PGR-202ENST00000325455 13748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 GNG13-201ENST00000248150 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 HTR2C-202ENST00000371950 4652 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 MIR187-201ENST00000385062 109 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 FAM96B-201ENST00000422424 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL031316.1-202ENST00000441672 449 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 SS18L2P1-201ENST00000445923 213 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 LINC01974-201ENST00000575126 494 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 MIR4428-201ENST00000584884 73 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC020914.7-201ENST00000594477 545 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 RPARP-AS1-204ENST00000594818 445 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 PCBP1-AS1-359ENST00000630283 1063 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC131649.2-201ENST00000624925 4439 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 DDX3Y-202ENST00000360160 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 SETD5-205ENST00000407969 6463 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 MTF1-201ENST00000373036 7972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 SLC26A9-201ENST00000340781 4510 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 DLG2-202ENST00000330014 2789 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 MTHFD1P1-201ENST00000413059 2764 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 MAPK10-242ENST00000639242 3088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 SLC13A3-202ENST00000290317 3994 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZEB2-236ENST00000636471 9583 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL096816.1-201ENST00000623300 2920 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 LRP6-206ENST00000543091 4774 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 MTMR8-201ENST00000374852 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 LCA5-201ENST00000369846 4542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 G3BP2-203ENST00000395719 4217 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 GIGYF2-201ENST00000373563 5847 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 COL24A1-201ENST00000370571 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 OR9I1-203ENST00000641478 3027 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 NBR1-201ENST00000341165 4656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 LUZP1-202ENST00000314174 3715 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 AP001043.1-202ENST00000380931 5027 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 DENND2C-202ENST00000393276 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 SSPO-201ENST00000378016 15589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 NTRK3-201ENST00000317501 3826 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 CTNND1-203ENST00000361391 6232 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 CTNND1-204ENST00000361796 6226 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 SLC7A2-201ENST00000004531 7560 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 MAP4K4-212ENST00000456652 3855 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 SLC23A2-202ENST00000379333 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 PLS3-202ENST00000355899 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 SVEP1-203ENST00000401783 12350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZFP62-207ENST00000512132 4010 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 RAPGEF5-202ENST00000401957 6159 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZNF761-202ENST00000432094 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 GPR1-AS-201ENST00000623040 3708 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 SPHKAP-202ENST00000392056 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 LRIG2-201ENST00000361127 11555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 MARF1-201ENST00000396368 7743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZNF268-213ENST00000542986 3773 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 SIPA1L1-211ENST00000555818 7831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-8Q9BYQ9 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116 ms