Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAXBP1Q9Y5B6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms