Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRELID3BQ9Y3B1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms