Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALD1Q9ULE6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALD1Q9ULE6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALD1Q9ULE6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALD1Q9ULE6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALD1Q9ULE6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALD1Q9ULE6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALD1Q9ULE6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALD1Q9ULE6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALD1Q9ULE6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALD1Q9ULE6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PALD1Q9ULE6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALD1Q9ULE6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALD1Q9ULE6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALD1Q9ULE6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALD1Q9ULE6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALD1Q9ULE6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALD1Q9ULE6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALD1Q9ULE6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALD1Q9ULE6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALD1Q9ULE6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALD1Q9ULE6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALD1Q9ULE6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PALD1Q9ULE6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALD1Q9ULE6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALD1Q9ULE6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALD1Q9ULE6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALD1Q9ULE6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALD1Q9ULE6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALD1Q9ULE6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALD1Q9ULE6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PALD1Q9ULE6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALD1Q9ULE6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALD1Q9ULE6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms