Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL19

RARRES3, Retinoic acid receptor responder protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES3Q9UL19 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RARRES3Q9UL19 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms