Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC42EP3Q9UKI2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms