Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CWC25Q9NXE8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms