Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV06

DCAF13, DDB1- and CUL4-associated factor 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF13Q9NV06 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCAF13Q9NV06 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms