Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA0

SLC22A11, Solute carrier family 22 member 11, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A11Q9NSA0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC22A11Q9NSA0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms