Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHST12Q9NRB3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHST12Q9NRB3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHST12Q9NRB3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHST12Q9NRB3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHST12Q9NRB3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHST12Q9NRB3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHST12Q9NRB3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHST12Q9NRB3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHST12Q9NRB3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHST12Q9NRB3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHST12Q9NRB3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHST12Q9NRB3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHST12Q9NRB3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHST12Q9NRB3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHST12Q9NRB3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CHST12Q9NRB3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHST12Q9NRB3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHST12Q9NRB3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHST12Q9NRB3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHST12Q9NRB3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHST12Q9NRB3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHST12Q9NRB3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHST12Q9NRB3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHST12Q9NRB3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHST12Q9NRB3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHST12Q9NRB3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CHST12Q9NRB3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHST12Q9NRB3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHST12Q9NRB3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHST12Q9NRB3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHST12Q9NRB3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHST12Q9NRB3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHST12Q9NRB3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHST12Q9NRB3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHST12Q9NRB3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CHST12Q9NRB3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHST12Q9NRB3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHST12Q9NRB3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHST12Q9NRB3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHST12Q9NRB3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHST12Q9NRB3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHST12Q9NRB3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHST12Q9NRB3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CHST12Q9NRB3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHST12Q9NRB3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHST12Q9NRB3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHST12Q9NRB3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms