Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BHLHE41Q9C0J9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE41Q9C0J9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms