Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC8.96□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC8.96□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms